Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4bP01029 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4bP01029 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4bP01029 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4bP01029 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4bP01029 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4bP01029 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4bP01029 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4bP01029 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4bP01029 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4bP01029 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4bP01029 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4bP01029 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4bP01029 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4bP01029 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4bP01029 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
C4bP01029 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4bP01029 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4bP01029 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4bP01029 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4bP01029 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4bP01029 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4bP01029 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4bP01029 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4bP01029 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4bP01029 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4bP01029 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C4bP01029 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C4bP01029 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4bP01029 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4bP01029 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4bP01029 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4bP01029 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4bP01029 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C4bP01029 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4bP01029 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4bP01029 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4bP01029 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4bP01029 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4bP01029 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4bP01029 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C4bP01029 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4bP01029 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4bP01029 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4bP01029 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4bP01029 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4bP01029 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4bP01029 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4bP01029 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4bP01029 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4bP01029 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4bP01029 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4bP01029 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4bP01029 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4bP01029 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4bP01029 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4bP01029 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4bP01029 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4bP01029 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4bP01029 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4bP01029 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4bP01029 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4bP01029 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4bP01029 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
C4bP01029 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4bP01029 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4bP01029 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
C4bP01029 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4bP01029 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4bP01029 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4bP01029 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4bP01029 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
C4bP01029 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4bP01029 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4bP01029 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4bP01029 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4bP01029 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4bP01029 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C4bP01029 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C4bP01029 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C4bP01029 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C4bP01029 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C4bP01029 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4bP01029 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4bP01029 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4bP01029 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4bP01029 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4bP01029 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4bP01029 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4bP01029 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4bP01029 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4bP01029 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4bP01029 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4bP01029 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4bP01029 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4bP01029 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4bP01029 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4bP01029 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4bP01029 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4bP01029 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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