Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopeO89079 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopeO89079 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopeO89079 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CopeO89079 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopeO89079 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopeO89079 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopeO89079 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopeO89079 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopeO89079 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopeO89079 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopeO89079 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopeO89079 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CopeO89079 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CopeO89079 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CopeO89079 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CopeO89079 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CopeO89079 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CopeO89079 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CopeO89079 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CopeO89079 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CopeO89079 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CopeO89079 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CopeO89079 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CopeO89079 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CopeO89079 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CopeO89079 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CopeO89079 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CopeO89079 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CopeO89079 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CopeO89079 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CopeO89079 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CopeO89079 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CopeO89079 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CopeO89079 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CopeO89079 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CopeO89079 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CopeO89079 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CopeO89079 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CopeO89079 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CopeO89079 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CopeO89079 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CopeO89079 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CopeO89079 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CopeO89079 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CopeO89079 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CopeO89079 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CopeO89079 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CopeO89079 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CopeO89079 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CopeO89079 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CopeO89079 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CopeO89079 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CopeO89079 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CopeO89079 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CopeO89079 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CopeO89079 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CopeO89079 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CopeO89079 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CopeO89079 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CopeO89079 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CopeO89079 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CopeO89079 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CopeO89079 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CopeO89079 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CopeO89079 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CopeO89079 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CopeO89079 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CopeO89079 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CopeO89079 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CopeO89079 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CopeO89079 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CopeO89079 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CopeO89079 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CopeO89079 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CopeO89079 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CopeO89079 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CopeO89079 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CopeO89079 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CopeO89079 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CopeO89079 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CopeO89079 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CopeO89079 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CopeO89079 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CopeO89079 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CopeO89079 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CopeO89079 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CopeO89079 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CopeO89079 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CopeO89079 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CopeO89079 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CopeO89079 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CopeO89079 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CopeO89079 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CopeO89079 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CopeO89079 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CopeO89079 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CopeO89079 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CopeO89079 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CopeO89079 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms