Protein–RNA interactions for Protein: O88875

Cd160, CD160 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd160O88875 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd160O88875 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd160O88875 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd160O88875 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd160O88875 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd160O88875 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd160O88875 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd160O88875 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd160O88875 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd160O88875 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd160O88875 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd160O88875 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd160O88875 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd160O88875 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd160O88875 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd160O88875 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd160O88875 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms