Protein–RNA interactions for Protein: O88602

Cacng2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng2O88602 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacng2O88602 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacng2O88602 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms