Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CntfrO88507 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CntfrO88507 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CntfrO88507 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CntfrO88507 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CntfrO88507 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CntfrO88507 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CntfrO88507 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CntfrO88507 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CntfrO88507 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CntfrO88507 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CntfrO88507 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CntfrO88507 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CntfrO88507 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CntfrO88507 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CntfrO88507 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CntfrO88507 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CntfrO88507 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CntfrO88507 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CntfrO88507 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms