Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nid2O88322 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nid2O88322 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nid2O88322 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nid2O88322 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nid2O88322 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nid2O88322 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nid2O88322 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nid2O88322 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nid2O88322 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nid2O88322 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nid2O88322 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nid2O88322 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms