Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vamp4O70480 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vamp4O70480 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms