Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dsg2O55111 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg2O55111 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms