Protein–RNA interactions for Protein: O55038

Cxcl13, C-X-C motif chemokine 13, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl13O55038 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl13O55038 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl13O55038 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl13O55038 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl13O55038 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl13O55038 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl13O55038 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl13O55038 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl13O55038 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl13O55038 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl13O55038 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl13O55038 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cxcl13O55038 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cxcl13O55038 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cxcl13O55038 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cxcl13O55038 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl13O55038 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl13O55038 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl13O55038 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl13O55038 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cxcl13O55038 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl13O55038 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl13O55038 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl13O55038 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl13O55038 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl13O55038 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl13O55038 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl13O55038 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl13O55038 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl13O55038 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl13O55038 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl13O55038 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxcl13O55038 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl13O55038 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl13O55038 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl13O55038 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl13O55038 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl13O55038 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl13O55038 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl13O55038 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl13O55038 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl13O55038 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl13O55038 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxcl13O55038 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms