Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb2O55029 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb2O55029 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copb2O55029 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copb2O55029 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copb2O55029 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms