Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1bO55017 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms