Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn5O54942 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Cldn5O54942 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn5O54942 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn5O54942 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn5O54942 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn5O54942 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn5O54942 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn5O54942 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn5O54942 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn5O54942 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn5O54942 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms