Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Itgb3O54890 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itgb3O54890 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itgb3O54890 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Itgb3O54890 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Itgb3O54890 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itgb3O54890 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itgb3O54890 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itgb3O54890 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itgb3O54890 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itgb3O54890 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itgb3O54890 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itgb3O54890 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itgb3O54890 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itgb3O54890 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itgb3O54890 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itgb3O54890 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms