Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Atp10aO54827 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atp10aO54827 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atp10aO54827 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atp10aO54827 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atp10aO54827 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atp10aO54827 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atp10aO54827 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atp10aO54827 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atp10aO54827 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atp10aO54827 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atp10aO54827 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atp10aO54827 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atp10aO54827 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Atp10aO54827 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atp10aO54827 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atp10aO54827 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atp10aO54827 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atp10aO54827 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp10aO54827 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms