Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DffaO54786 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DffaO54786 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DffaO54786 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DffaO54786 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DffaO54786 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DffaO54786 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DffaO54786 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DffaO54786 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DffaO54786 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DffaO54786 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DffaO54786 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DffaO54786 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DffaO54786 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DffaO54786 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DffaO54786 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DffaO54786 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DffaO54786 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DffaO54786 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DffaO54786 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DffaO54786 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DffaO54786 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DffaO54786 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DffaO54786 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DffaO54786 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DffaO54786 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DffaO54786 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DffaO54786 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DffaO54786 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DffaO54786 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DffaO54786 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DffaO54786 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DffaO54786 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DffaO54786 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DffaO54786 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DffaO54786 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DffaO54786 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DffaO54786 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DffaO54786 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DffaO54786 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DffaO54786 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DffaO54786 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DffaO54786 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DffaO54786 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DffaO54786 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DffaO54786 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DffaO54786 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
DffaO54786 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DffaO54786 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
DffaO54786 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
DffaO54786 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
DffaO54786 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DffaO54786 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DffaO54786 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DffaO54786 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DffaO54786 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DffaO54786 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DffaO54786 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DffaO54786 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DffaO54786 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DffaO54786 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DffaO54786 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DffaO54786 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DffaO54786 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DffaO54786 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DffaO54786 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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DffaO54786 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DffaO54786 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DffaO54786 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
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DffaO54786 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DffaO54786 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DffaO54786 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DffaO54786 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DffaO54786 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DffaO54786 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DffaO54786 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DffaO54786 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DffaO54786 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DffaO54786 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DffaO54786 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DffaO54786 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DffaO54786 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DffaO54786 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DffaO54786 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DffaO54786 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DffaO54786 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DffaO54786 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DffaO54786 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DffaO54786 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DffaO54786 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DffaO54786 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DffaO54786 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DffaO54786 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DffaO54786 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DffaO54786 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DffaO54786 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DffaO54786 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DffaO54786 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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