Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms