Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FxnO35943 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FxnO35943 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FxnO35943 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FxnO35943 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FxnO35943 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FxnO35943 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FxnO35943 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FxnO35943 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FxnO35943 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FxnO35943 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FxnO35943 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FxnO35943 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FxnO35943 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FxnO35943 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FxnO35943 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FxnO35943 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FxnO35943 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FxnO35943 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FxnO35943 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FxnO35943 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FxnO35943 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FxnO35943 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FxnO35943 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FxnO35943 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FxnO35943 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FxnO35943 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FxnO35943 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FxnO35943 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FxnO35943 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FxnO35943 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FxnO35943 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FxnO35943 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FxnO35943 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FxnO35943 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FxnO35943 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FxnO35943 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FxnO35943 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FxnO35943 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FxnO35943 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FxnO35943 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FxnO35943 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FxnO35943 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FxnO35943 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FxnO35943 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FxnO35943 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FxnO35943 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FxnO35943 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FxnO35943 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FxnO35943 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FxnO35943 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FxnO35943 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FxnO35943 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FxnO35943 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FxnO35943 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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FxnO35943 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FxnO35943 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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FxnO35943 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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FxnO35943 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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FxnO35943 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FxnO35943 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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FxnO35943 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FxnO35943 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FxnO35943 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FxnO35943 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FxnO35943 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FxnO35943 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FxnO35943 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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FxnO35943 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FxnO35943 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FxnO35943 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FxnO35943 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FxnO35943 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FxnO35943 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FxnO35943 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FxnO35943 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FxnO35943 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FxnO35943 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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FxnO35943 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FxnO35943 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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FxnO35943 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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