Protein–RNA interactions for Protein: O35912

Emp3, Epithelial membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emp3O35912 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Emp3O35912 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emp3O35912 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emp3O35912 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Emp3O35912 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emp3O35912 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emp3O35912 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emp3O35912 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emp3O35912 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emp3O35912 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emp3O35912 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Emp3O35912 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Emp3O35912 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Emp3O35912 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emp3O35912 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emp3O35912 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emp3O35912 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emp3O35912 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emp3O35912 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emp3O35912 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emp3O35912 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Emp3O35912 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emp3O35912 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emp3O35912 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emp3O35912 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emp3O35912 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Emp3O35912 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Emp3O35912 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emp3O35912 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emp3O35912 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emp3O35912 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emp3O35912 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Emp3O35912 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Emp3O35912 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Emp3O35912 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms