Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp100O35892 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp100O35892 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp100O35892 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp100O35892 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp100O35892 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp100O35892 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp100O35892 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sp100O35892 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sp100O35892 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sp100O35892 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sp100O35892 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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