Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Stag2O35638 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stag2O35638 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Stag2O35638 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Stag2O35638 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Stag2O35638 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stag2O35638 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stag2O35638 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stag2O35638 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stag2O35638 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stag2O35638 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms