Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccrl2O35457 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccrl2O35457 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms