Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ColqO35348 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ColqO35348 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ColqO35348 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ColqO35348 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ColqO35348 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ColqO35348 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ColqO35348 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ColqO35348 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ColqO35348 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ColqO35348 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ColqO35348 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ColqO35348 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ColqO35348 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ColqO35348 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ColqO35348 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ColqO35348 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ColqO35348 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ColqO35348 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ColqO35348 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ColqO35348 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ColqO35348 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ColqO35348 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ColqO35348 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ColqO35348 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ColqO35348 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ColqO35348 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ColqO35348 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ColqO35348 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ColqO35348 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ColqO35348 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ColqO35348 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ColqO35348 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ColqO35348 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ColqO35348 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ColqO35348 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ColqO35348 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ColqO35348 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ColqO35348 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ColqO35348 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ColqO35348 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ColqO35348 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ColqO35348 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ColqO35348 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ColqO35348 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ColqO35348 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ColqO35348 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ColqO35348 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ColqO35348 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ColqO35348 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ColqO35348 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ColqO35348 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ColqO35348 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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ColqO35348 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ColqO35348 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ColqO35348 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ColqO35348 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ColqO35348 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ColqO35348 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ColqO35348 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ColqO35348 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ColqO35348 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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ColqO35348 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ColqO35348 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ColqO35348 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ColqO35348 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ColqO35348 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ColqO35348 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ColqO35348 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ColqO35348 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ColqO35348 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ColqO35348 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
ColqO35348 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ColqO35348 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ColqO35348 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ColqO35348 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ColqO35348 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ColqO35348 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ColqO35348 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ColqO35348 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ColqO35348 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ColqO35348 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ColqO35348 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ColqO35348 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ColqO35348 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ColqO35348 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ColqO35348 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ColqO35348 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ColqO35348 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ColqO35348 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ColqO35348 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ColqO35348 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ColqO35348 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ColqO35348 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ColqO35348 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ColqO35348 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ColqO35348 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ColqO35348 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms