Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms