Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Ptpn9O35239 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Ptpn9O35239 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Ptpn9O35239 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Ptpn9O35239 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Ptpn9O35239 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Ptpn9O35239 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Ptpn9O35239 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Ptpn9O35239 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms