Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad6O35182 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad6O35182 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad6O35182 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad6O35182 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad6O35182 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad6O35182 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad6O35182 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smad6O35182 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smad6O35182 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad6O35182 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms