Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Kcns1O35173 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Kcns1O35173 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Kcns1O35173 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcns1O35173 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms