Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casq1O09165 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casq1O09165 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casq1O09165 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Casq1O09165 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casq1O09165 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casq1O09165 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casq1O09165 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casq1O09165 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casq1O09165 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casq1O09165 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casq1O09165 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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