Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms