Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra2O08842 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms