Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CckarO08786 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CckarO08786 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CckarO08786 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CckarO08786 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CckarO08786 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CckarO08786 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CckarO08786 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CckarO08786 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CckarO08786 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CckarO08786 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CckarO08786 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CckarO08786 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CckarO08786 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CckarO08786 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CckarO08786 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CckarO08786 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CckarO08786 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CckarO08786 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CckarO08786 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CckarO08786 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CckarO08786 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CckarO08786 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CckarO08786 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CckarO08786 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CckarO08786 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CckarO08786 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CckarO08786 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CckarO08786 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CckarO08786 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CckarO08786 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CckarO08786 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CckarO08786 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CckarO08786 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CckarO08786 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CckarO08786 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CckarO08786 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CckarO08786 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CckarO08786 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CckarO08786 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CckarO08786 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CckarO08786 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CckarO08786 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CckarO08786 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CckarO08786 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CckarO08786 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CckarO08786 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CckarO08786 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CckarO08786 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CckarO08786 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CckarO08786 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CckarO08786 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CckarO08786 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CckarO08786 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CckarO08786 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CckarO08786 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CckarO08786 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CckarO08786 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CckarO08786 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CckarO08786 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CckarO08786 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CckarO08786 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CckarO08786 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CckarO08786 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CckarO08786 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CckarO08786 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CckarO08786 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CckarO08786 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CckarO08786 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CckarO08786 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CckarO08786 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CckarO08786 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CckarO08786 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CckarO08786 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CckarO08786 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CckarO08786 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CckarO08786 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CckarO08786 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CckarO08786 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CckarO08786 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CckarO08786 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CckarO08786 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CckarO08786 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CckarO08786 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CckarO08786 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CckarO08786 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CckarO08786 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CckarO08786 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CckarO08786 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CckarO08786 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CckarO08786 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CckarO08786 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CckarO08786 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CckarO08786 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CckarO08786 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CckarO08786 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CckarO08786 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CckarO08786 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CckarO08786 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CckarO08786 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms