Protein–RNA interactions for Protein: O08584

Klf6, Krueppel-like factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf6O08584 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf6O08584 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf6O08584 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf6O08584 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Klf6O08584 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf6O08584 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf6O08584 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms