Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ascl4M0QW46 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms