Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms