Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp955bL7N232 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms