Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm44643-201ENSMUST00000208542 674 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm13874-202ENSMUST00000135348 941 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Kng2-201ENSMUST00000039338 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.9 ms