Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms