Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms