Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm2035J3QP87 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2035J3QP87 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms