Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX5

Shisa8, Cysteine-knot AMPAR-modulating protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa8J3QNX5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shisa8J3QNX5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shisa8J3QNX5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shisa8J3QNX5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms