Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp616J3QN14 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms