Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20834J3QM72 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20834J3QM72 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20834J3QM72 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20834J3QM72 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20834J3QM72 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20834J3QM72 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20834J3QM72 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20834J3QM72 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20834J3QM72 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20834J3QM72 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20834J3QM72 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20834J3QM72 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20834J3QM72 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20834J3QM72 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms