Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm6594J3QM43 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms