Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem200cJ3QK46 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem200cJ3QK46 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms