Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
7530416G11RikJ3QJX6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms