Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms