Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Gm20828J3KMI7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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