Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm29394H3BIW7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm29394H3BIW7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms