Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
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Usp17lcG5E8I7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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Usp17lcG5E8I7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp17lcG5E8I7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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Usp17lcG5E8I7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp17lcG5E8I7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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