Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r58G3X9U3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms