Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf148G3X9R7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms